El programa de Teología que ofrece la Universidad Santo Tomás se inscribe en la trayectoria intelectual y teológica de la Comunidad Dominicana,  caracterizada por la reflexión crítica sobre la experiencia de la fe cristiana y la realidad sociocultural y política.  El Programa de Teología se caracteriza por profundizar en la formación doctrinal sobre la base de la investigación de los fundamentos bíblicos y patrísticos, junto con los desarrollos históricos y sistemáticos de la reflexión teológica en su contexto general, eclesial y ecuménico; con especial atención al ámbito latinoamericano y sus desafíos pastorales y ecoambientales. Lleva el sello de la tradición teológica dominicana,  del humanismo cristiano y  del pensamiento de Santo Tomás de Aquino y de otros maestros seguidores de su método teológico, con apertura al diálogo con otras escuelas y tradiciones teológicas de Oriente y de Occidente.